土地确权证已经下来了 - 但是现在发现有争议怎么办

律师解析：对土地有争议的，待争议解决后再确权登记颁证。
建议双方当事人通过协商解决，也可以请求村民委员会、乡（镇）人民政府等调解解决。
当事人不愿协商、调解或者协商、调解不成的，可以向农村土地承包仲裁机构申请仲裁，也可以直接向人民法院起诉。法律依据：《民法典》第267条
私人的合法财产受法律保护，禁止任何组织或者个人侵占、哄抢、破坏。